År 1965 bildades Fyrisåns vattenvårdsförbund med uppgift att verka för vattenvården inom Fyrisåns och Hågaåns vattensystem samt andra åar som mynnar i Ekoln. 1990 ombildades vattenvårdsförbundet till Fyrisåns vattenförbund.
Idag är verksamheten inriktad på att genomföra och sammanställa vattenundersökningar, initiera åtgärder för att uppnå god status i sjöar och vattendrag, informera allmänheten och myndigheter m.m.